Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Arid4aF8VPQ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms