Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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H2-M1F7CXU4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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H2-M1F7CXU4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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H2-M1F7CXU4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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H2-M1F7CXU4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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H2-M1F7CXU4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M1F7CXU4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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H2-M1F7CXU4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms