Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8005F6YKY3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8005F6YKY3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8005F6YKY3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8005F6YKY3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8005F6YKY3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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