Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6482F6YHC1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms