Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8444F6XS56 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8444F6XS56 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms