Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933403O08RikF6UK53 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933403O08RikF6UK53 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms