Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syngap1F6SEU4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngap1F6SEU4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms