Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf4E9QAP7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf4E9QAP7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms