Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod3E9QA62 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod3E9QA62 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms