Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc7bE9Q9Y3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc7bE9Q9Y3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms