Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzd7E9Q9W7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd7E9Q9W7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms