Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh18E9Q9Q6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms