Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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TrdnE9Q9K5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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TrdnE9Q9K5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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TrdnE9Q9K5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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TrdnE9Q9K5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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TrdnE9Q9K5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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TrdnE9Q9K5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrdnE9Q9K5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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