Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd1E9Q3H4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms