Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd4E9Q289 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd4E9Q289 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Acbd4E9Q289 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acbd4E9Q289 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms