Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc171E9Q1U1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms