Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrp3E9Q1T6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms