Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Gm3893E9Q1I1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Gm3893E9Q1I1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Gm3893E9Q1I1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Gm3893E9Q1I1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms