Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myo5cE9Q1F5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5cE9Q1F5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms