Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms