Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.33■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms