Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc175E9PVB3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms