Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcn1E9PVA8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gcn1E9PVA8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gcn1E9PVA8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms