Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan18E9PUD6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan18E9PUD6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms