Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ38

Gm45062, Predicted gene 45062, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45062E0CZ38 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45062E0CZ38 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45062E0CZ38 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms