Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl3E0CZ16 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl3E0CZ16 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms