Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3676D3Z236 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3676D3Z236 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms