Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3543D3Z235 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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