Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms