Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms