Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyp26c1B2RXA7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms