Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Phf3B2RQG2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf3B2RQG2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms