Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms