Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms