Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprsB0V2N1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprsB0V2N1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms