Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms