Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm16430A6X8J1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm16430A6X8J1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms