Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3173A6NAS3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.9 ms