Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms