Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Vmn1r232A2RTT5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms