Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf39A2RT81 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf39A2RT81 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms