Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4931406B18RikA2RSL7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931406B18RikA2RSL7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms