Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xlr4aA2BI40 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xlr4aA2BI40 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 409.5 ms