Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf2A2AT37 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms