Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pramef17A2ASJ1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms