Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c4A2ANA3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms