Protein–RNA interactions for Protein: A2AKE5

1700003F12Rik, RIKEN cDNA 1700003F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003F12RikA2AKE5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700003F12RikA2AKE5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700003F12RikA2AKE5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms