Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Frmpd1A2AKB4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Frmpd1A2AKB4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms