Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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Lcn6A2AJB9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Lcn6A2AJB9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Lcn6A2AJB9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn6A2AJB9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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