Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ambra1A2AH22 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ambra1A2AH22 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ambra1A2AH22 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ambra1A2AH22 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ambra1A2AH22 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ambra1A2AH22 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ambra1A2AH22 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms